FILOGENIA MOLECULAR DO VÍRUS SARS-CoV-2 NO ESTADO DO ESPÍRITO SANTO, BRASIL
Nome: RENATA TOREZANI DA SILVA
Tipo: Dissertação de mestrado acadêmico
Data de publicação: 02/08/2022
Orientador:
Nome |
Papel |
|---|---|
| GREICIANE GABURRO PANETO | Co-orientador |
| TEODIANO FREIRE BASTOS FILHO | Orientador |
Banca:
| Nome |
Papel |
|---|---|
| GREICIANE GABURRO PANETO | Coorientador |
| HUGO VERLI | Examinador Externo |
| SANDRA LÚCIA VENTORIN VON ZEIDLER | Examinador Interno |
| TEODIANO FREIRE BASTOS FILHO | Orientador |
Resumo: O SARS-CoV-2 (coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2) é uma cepa da espécie SARS-CoV. Essa espécie pertence à família Coronaviridae e ao gênero Betacoronavirus. O vírus é responsável por causar uma grave crise respiratória, a qual foi relatada pela primeira vez em dezembro de 2019, em Wuhan, na China. Essa doença ficou conhecida como Doença do Coronavírus de 2019 (COVID-19, Coronavirus Disease 2019). Grande parte da comunidade científica direcionou seus estudos para compreender esse novo vírus, seus efeitos, diversidade e distribuição geográfica. Embora diversos países e regiões do Brasil já tivessem realizado estudos filogenéticos para compreender melhor a dinâmica do vírus, nenhum estudo havia sido realizado no estado do Espírito Santo, Brasil. Desta forma, o presente estudo visou identificar quais linhagens circulavam no estado e quais eram suas possíveis rotas de entrada na região. Para isso, foram utilizadas sequências depositadas no banco de dados GISAID de casos positivos coletados no limite geográfico do Espírito Santo, assim como dos estados vizinhos, Rio de Janeiro (RJ), Bahia (BA) e Minas Gerais (MG). Foi possível identificar que no período de 29 de fevereiro de 2020 até o dia 19 de agosto de 2021 nove linhagens foram identificadas no estado, sendo que as linhagens B.1.1.33 e a Gamma foram as de maior predominância. A linhagem Delta estava em ascensão neste período do estudo, demonstrando que poderia ser a nova variante dominante no estado. Também foi possível identificar a co-circulação de mais de uma linhagem simultaneamente. A reconstrução filogenética realizada com amostras dos estados vizinhos indicou que possivelmente o vírus pode ter múltiplas entradas no estado.
